Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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