Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms