Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms