Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms