Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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