Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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