Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK13-1Q9NX77 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms