Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms