Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A2Q9NTI2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A2Q9NTI2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms