Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
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