Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS45Q9NRW7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms