Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms