Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms