Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms