Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms