Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms