Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLCC1Q96S66 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms