Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms