Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms