Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms