Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF1Q92879 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms