Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms