Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD1Q8N9F7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms