Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT27Q7Z3Y8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms