Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms