Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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TPGS1Q6ZTW0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TPGS1Q6ZTW0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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