Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC141Q6ZP82 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms