Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCD1Q6ZMY3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms