Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms