Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms