Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms