Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms