Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms