Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms