Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms