Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms