Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF3Q3KNV8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms