Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms