Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT24Q2M2I5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT24Q2M2I5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT24Q2M2I5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT24Q2M2I5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT24Q2M2I5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT24Q2M2I5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT24Q2M2I5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT24Q2M2I5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms