Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms