Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms