Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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