Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SSX1Q16384 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SSX1Q16384 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SSX1Q16384 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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