Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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