Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms