Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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