Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKD1Q15139 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms