Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EEA1Q15075 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms