Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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