Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NWD1Q149M9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NWD1Q149M9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms